のび太はいつものように、ドラえもんから借りた道具をつかっていたずらをしていた。

しかし、そのとき使っていた道具の影響によりドラえもんを開発した人間の存在が消えてしまった。
開発者が消えてしまったことで、連鎖的にドラえもんの存在もこの世から消滅してしまった。

歴史を元の状態に戻すためにのび太、しずか、ジャイアン、スネ夫、出来杉らが力を合わせてドラえもんを作ろうと奮闘する。これがドラえもんの最終回である。